कठोर आसमान की पृष्ठभूमि में मुलायम आकाशीय सवारी: जनसंख्या गतिशीलता का बैज़ियन कोआलेसेंट-आधारित अनुमान

किंगमैन की कोआलेसेंट प्रक्रिया आणविक अनुक्रमों से जनसंख्या आनुवंशिकी मॉडल पैरामीटर के अनुमान के लिए द्वार खोलती है। यहां एक महत्वपूर्ण पैरामीटर प्रभावी जनसंख्या आकार है। इस मात्रा का अस्थायी परिवर्तन जनसंख्या के जनसांख्यिकीय इतिहास को वर्णित करता है। चूंकि शोधकर्ता अक्सर डेटा के लिए प्रभावी जनसंख्या आकार गतिशीलताओं का वर्णन करने वाले निश्चित मॉडल को पूर्वानुमान कर पाने में असमर्थ होते हैं, कई परिवर्तन बिंदु (MCP) मॉडलों पर आधारित गैर-पैरामीट्रिक वक्र-फिटिंग विधियों का विकास किया गया है। हम परिवर्तन बिंदु मॉडलिंग का एक विकल्प प्रस्तावित करते हैं जो प्रभावी जनसंख्या आकार का अस्थायी समतलीकरण प्राप्त करने के लिए गॉसियन मार्कोव रैंडम फील्ड का लाभ उठाता है। हमारे दृष्टिकोण का मुख्य लाभ यह है कि, MCP मॉडलों के विपरीत, स्पष्ट अस्थायी समतलीकरण को मजबूत पूर्व निर्णयों की आवश्यकता नहीं होती। जनसंख्या गतिशीलता के पश्चात वितरण का अनुमान लगाने के लिए, हम उच्च संरचित गॉसियन मॉडलों के लिए डिज़ाइन किए गए कुशल, त्वरित मिश्रण मार्कोव चेन मोंटे कार्लो एल्गोरिदम का उपयोग करते हैं। एक सिमुलेशन अध्ययन में, हम प्रदर्शित करते हैं कि प्रस्तावित अस्थायी समतलीकरण विधि, जिसे बैज़ियन स्काईराइड कहा जाता है, सभी सिमुलेशन परिदृश्यों में "सच्चे" जनसंख्या आकार की पथों को सफलतापूर्वक पुनर्प्राप्त करती है और मजबूत पूर्व धारणाओं को जगाए बिना MCP दृष्टिकोण के साथ अच्छी प्रतिस्पर्धा करती है। हम अपने बैज़ियन स्काईराइड विधि को 2 वास्तविक डेटा सेट पर लागू करते हैं। हम मिस्र में समकालिक रूप से संकलित हेपेटाइटिस सी वायरस के अनुक्रमों का विश्लेषण करते हैं, जो वायरल जनसंख्या गतिशीलता के सभी प्रमुख ज्ञात पहलुओं को नकल करते हैं। अगला, हम तीन फ्लू सत्रों के दौरान क्रमिक रूप से नमूदा मानव इन्फ्लूएंजा ए हीमाग्लुटिनिन अनुक्रमों के जनसांख्यिकीय इतिहास का अनुमान लगाते हैं।