प्रोस्टेट कैंसर RNA बायोमार्कर विश्लेषण के लिए निकाली गई मूत्र की प्रसंस्करण

पृष्ठभूमि: निकाली गई मूत्र के नमूनों में प्रोस्टेट ट्यूमर्स से निकले हुए कोशिकाएँ होती हैं। क्या उच्च गुणवत्ता वाला RNA मूत्र में कोशिकाओं से हर दाता से बहु-मार्कर विश्लेषण के लिए प्राप्त किया जा सकता है? इसके अलावा, क्या मूत्र दान को संभवतः सबसे सरल बनाया जा सकता है, जो एक प्रयोगशाला परीक्षण के लिए व्यावहारिक है, बिना प्रोस्टेट मसाज के शामिल किए (जैसा कि PCA3 परीक्षण के लिए संकेतित है), जो बार-बार संग्रह को रोकता है; इसे दिन के एक विशिष्ट समय (जैसे, पहला या दूसरा मूत्र) पर करना आवश्यक है; और सीमित आणविक जीवविज्ञान क्षमता वाले क्लिनिकों में नमूनों की त्वरित प्रसंस्करण की आवश्यकता होती है? विधियाँ: संग्रहित मूत्र के नमूनों को पैलेट किया गया, और RNA को cDNA संश्लेषण और इन विट्रो ट्रांस्क्रिप्शन के लिए संसाधित किया गया ताकि संवर्धित सेंस aRNA उत्पन्न किया जा सके। परिणामी aRNA को संभवित परिवर्तनों के लिए कठोरता से विश्लेषित किया गया। मूत्र के नमूनों के लिए डीएमएसओ को सेल संरक्षण के रूप में उपयोग किया गया। परिणाम: दो विभिन्न संस्थानों से एकत्र किए गए 100 से अधिक नमूनों के लिए उच्च गुणवत्ता वाला aRNA प्राप्त हुआ। RNA संवर्धन की प्रक्रिया ने कुछ नमूनों में सह-आइसोलेटेड DNA को हटा दिया, जिसने RNA संवर्धन को प्रभावित नहीं किया। संवर्धन ने उन जीनों को संचारित नहीं किया जो अनुपस्थित थे और अन्य अभिव्यक्ति परिवर्तनों का उत्पादन किया। सेंस aRNA का उपयोग व्यक्तिपरक रोगियों के लिए मूत्रीय ट्रांसक्रिप्टोमी उत्पन्न करने के लिए किया जा सकता है। RNA संरक्षण के लिए मूत्र नमूनों में कोई चात्रोपिक एजेंट नहीं जोड़ा गया ताकि सुपरनटेंट को स्रावित प्रोटीन बायोमार्कर के विश्लेषण के लिए उपयोग किया जा सके। दान का समय महत्वपूर्ण नहीं था क्योंकि मरीजों को पूरे दिन देखा गया। डीएमएसओ मूत्र के फ्रीज़िंग के लिए प्रभावी सेल संरक्षण था। निष्कर्ष: मूत्रीय RNA को प्रोस्टेट कैंसर बायोमार्कर विश्लेषण के लिए आसानी से अलग किया और संवर्धित किया जा सकता है। व्यक्तिगत रोगियों में उनके ट्यूमर से निकले ट्रांसक्रिप्ट का एक अद्वितीय सेट था।