डीएनए में आंतरिक G·T असमानताओं के थर्मोडायनामिक्स और NMR

1 M NaCl में घुलनशील आंतरिक G.T असमानताओं वाले 39 ओलिगोन्यूक्लियोटाइड्स के थर्मोडायनामिक्स को UV अवशोषण बनाम तापमान प्रोफाइल से निर्धारित किया गया। इन डेटा को छह अनुक्रमों के साहित्य मानों के साथ जोड़ा गया ताकि G.T असमानताओं और वॉटसन-क्रिक बेस जोड़ों के साथ 10 रेखीय स्वतंत्र ट्राइमर और टेट्रेमर अनुक्रमों के लिए पैरामीटर निकाले जा सकें। G.T असमानता के पैरामीटर DeltaG डिग्री 37, DeltaH डिग्री, DeltaS डिग्री, और TM के लिए औसत विचलनों के साथ क्रमशः 5.1%, 7.5%, 8.0%, और 1.4 डिग्री सेल्सियस की भविष्यवाणी करते हैं। ये भविष्यवाणियाँ निकटतम-पड़ोसी मॉडल के लिए अपेक्षित सीमाओं के भीतर हैं। डेटा दिखाते हैं कि एकल G.T असमानता का हेलिक्स स्थिरता में योगदान संदर्भ-निर्भर है और +1.05 kcal/mol (AGA/TTT) से -1.05 kcal/mol (CGC/GTG) के बीच होता है। G.T असमानताओं के लिए निकटतम-पड़ोसी मॉडल की प्रयोज्यता के कई परीक्षण वर्णित हैं। इमिनो प्रोटॉन रासायनिक शिफ्ट का विश्लेषण यह दर्शाता है कि G.T असमानताओं से संरचनात्मक विघटन अत्यधिक स्थानिक होते हैं। एक-आयामी NOE अंतर स्पेक्ट्रा दर्शाते हैं कि G.T असमानताएँ विविध संदर्भों में स्थिर हाइड्रोजन-बंधन वाले वॉबल जोड़े बनाती हैं। वॉटसन-क्रिक बेस जोड़ों के लिए परिष्कृत निकटतम-पड़ोसी पैरामीटर भी प्रस्तुत किए गए हैं।