हेटेरोजीनियस न्यूक्लियर राइबोन्यूक्लियोटीन (hnRNP) H/H′/F/2H9 परिवार की RNA बाइंडिंग विशिष्टता का निर्धारण

हेटेरोजीनियस न्यूक्लियर राइबोन्यूक्लियोटीन (hnRNP) H प्रोटीन परिवार के सदस्य, H, H', F, और 2H9, प्री-मआरएनए प्रोसेसिंग में शामिल होते हैं। हमने इन प्रोटीनों के स्प्लाइसिंग एक्सट्रैक्ट्स से चार RNA नियामक तत्वों के प्रति इनकी असेंबली का विश्लेषण किया: एक उच्च आसंजन hnRNP A1-बाइंडिंग साइट (WA1), एक अनुक्रम जो Rev-निर्भर निर्यात में शामिल होता है (p17gag INS), बैटा-ट्रोपॉमायोसिन जीन से एक एक्सोनिक स्प्लाइसिंग साइलेंसर, और एक इंट्रोनिक स्प्लाइसिंग नियामक (c-src जीन से डाउनस्ट्रीम कंट्रोल अनुक्रम (DCS)। पूरा परिवार WA1, अस्थिरता (INS), और बैटा-ट्रोपॉमायोसिन के सब्सट्रेट्स से बंधता है, और प्रत्येक के लिए कोर-बाइंडिंग साइट तीन G अवशेषों का एक सीक्वेंस है, जिसके बाद एक A होता है। इस अनुक्रम को वहन करने वाले छोटे क्षेत्रों को ऐसे सब्सट्रेट में स्थानांतरित करना जिसमें hnRNP H बाइंडिंग गतिविधि नहीं है, सभी परिवार के सदस्यों के बंधन को बढ़ावा देने के लिए पर्याप्त है। c-src DCS ने HeLa सेल एक्सट्रैक्ट्स से hnRNP H को संयोजित करने के लिए दिखाया गया है, hnRNP F नहीं, और हम दिखाते हैं कि hnRNP 2H9 इस तत्व से बंधता नहीं है। DCS में पांच G अवशेष होते हैं, जिनके बाद एक C होता है। C का A में उत्परिवर्तन DCS की विशिष्टता को एक ऐसे सब्सट्रेट में बदल देता है जो केवल hnRNP H/H' से बंधता है, सभी hnRNP H परिवार के सदस्यों के लिए एक बाइंडिंग साइट में। हम निष्कर्ष निकालते हैं कि अनुक्रम GGGA को सभी hnRNP H परिवार के प्रोटीन पहचानते हैं।