मानव कोलन कार्सिनोमा का मेटाबोलाइट प्रोफाइलिंग – टीसीए चक्र और एमिनो एसिड टर्नओवर का डेरैगुलेशन

पृष्ठभूमि: आनुवंशिक परिवर्तनों के अलावा, कोलोरैक्टल कैंसर के विकास और प्रगति को पोषण सेवन, हाइपरएलिमेंटेशन, और कोशीय मेटाबोलिक परिवर्तनों से जोड़ा गया है जो नए निदान और चिकित्सीय दृष्टिकोणों का आधार बन सकते हैं। हालाँकि, जीनोमिक्स और प्रोटियोमिक्स के विपरीत, खराब ट्यूमर में परिवर्तनों के व्यापक मेटाबोलोमिक अनुसंधान शायद ही किए गए हैं। परिणाम: इस अध्ययन में हमने सामान्य कोलन ऊतक और कोलोरैक्टल कैंसर ऊतक के एक सेट का पेयर किया हुआ नमूना गैस-क्रोमैटोग्राफी टाइम-ऑफ-फ्लाइट मास-स्पेक्ट्रोमी द्वारा जांचा, जिसने कुल 206 मेटाबोलाइट्स का मजबूत पता लगाया। कोलन कैंसर और सामान्य ऊतकों के मेटाबोलिक फ़िनोटाइप एक अनसुपervis्ड पीसीए विश्लेषण के पहले दो घटकों के लिए बोनफेरोनी सुधारित महत्व के स्तर पर भिन्न थे, p=0.00170 और p=0.00005 पर। बाद के सुपरवाइज्ड विश्लेषण ने 82 मेटाबोलाइट्स को p<0.01 पर महत्वपूर्ण रूप से भिन्न पाया। मेटाबोलाइट्स को मेटाबोलिक पाथवे में असामान्यताएं के साथ एक नए दृष्टिकोण द्वारा जोड़ा गया जो KEGG डेटाबेस इंटरैक्शन लैटिस में प्रत्येक जोड़े के मेटाबोलाइट्स की दूरी की गणना करता है। टीसीए चक्र के मध्यवर्ती और लिपिड कैंसर में डाउन-रेग्युलेटेड पाए गए, जबकि यूरेया चक्र के मेटाबोलाइट्स, प्यूराइन, पिरिमिडिन और एमिनो एसिड सामान्य कोलन म्यूकोसा की तुलना में आमतौर पर उच्च स्तर पर पाए गए। निष्कर्ष: यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि मेटाबोलिक प्रोफाइलिंग सामान्य और न्यूप्लास्टिक कोलन ऊतक के जैव रासायनिक फिनोटाइपिंग को उच्च महत्व के स्तर पर आसान बनाती है और आणविक पैथोलॉजी अनुसंधानों के लिए GC-TOF आधारित मेटाबोलोमिक्स को एक नए तरीके के रूप में इंगित करती है।