डेटाबेस अनुक्रमों में वेक्टर संदूषण पहचानने की एक विधि स्थापित करना।

प्रेरणा: न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम डेटाबेस निजी और शैक्षणिक अनुसंधान समुदायों के लिए अमूल्य उपकरण हैं, अनुक्रमों की पुनः प्राप्ति से लेकर समानता खोजना तक। डेटा गुणवत्ता से संबंधित कई मुद्दे, जैसे अनुक्रमण कलाकृतियों और त्रुटियों की उपस्थिति, डेटाबेस का सामना कर रहे हैं। हमने इन त्रुटियों के एक प्रमुख स्रोत की जांच की, अर्थात् वेक्टर-संदूषित अनुक्रमों की उपस्थिति। परिणाम: 180 वेक्टर पॉलीलिंकर अनुक्रमों के एक पैनल का उपयोग करते हुए, हमने जनबैंक रिलीज 95-96 में 0.36% या 3029 वेक्टर-मैचिंग अनुक्रम पाए, जिनकी औसत वेक्टर-मैचिंग लंबाई 72 न्यूक्लियोटाइड्स थी। वेक्टर-संदूषित अनुक्रमों की संख्या डेटाबेस के साथ बढ़ रही है; हालाँकि, प्रतिशत संदूषण 1982 से 1996 तक औसतन 0.28% के लगभग स्थिर रहा है। उपलब्धता: अनुक्रम समानता खोजने के माध्यम से वेक्टर पॉलीलिंकर अनुक्रमों के डेटाबेस तक पहुँच http://seqsim.ncgr.org/vector/ पर उपलब्ध है। संपर्क: gas@molinfo.com