मॉलिक्यूलर इंटरएक्शन्स पर आधारित जैविक फ़ंक्शन के लिए एक अंतलेकिन

प्रेरणाएँ: कई महत्वपूर्ण बायोइन्फ़ॉर्मेटिक्स गणनाएँ फ़ंक्शन के साथ गणना करने में शामिल होती हैं: उन संगणनात्मक संचालन को निष्पादित करना जिनके इनपुट या आउटपुट बायोमोलेक्यूल्स के फ़ंक्शनों के विवरण होते हैं। उदाहरणों में अनुक्रम और पथ डेटा बेस के लिए कार्यात्मक क्वेरी चलाना, और अनुक्रम से फ़ंक्शन की भविष्यवाणी के लिए एल्गोरिदम का मूल्यांकन करने के लिए कार्यात्मक समानता निर्धारित करना शामिल है। फ़ंक्शन के साथ गणना करने की एक पूर्वापेक्षा एक अंतलेख का अस्तित्व है जो फ़ंक्शन का एक संरचित सामांतर एन्कोडिंग प्रदान करता है। कार्यात्मक बायोइन्फ़ॉर्मेटिक्स बायोइन्फ़ॉर्मेटिक्स का एक उभरता हुआ उपक्षेत्र है जो जैविक फ़ंक्शन के साथ गणना के लिए अंतलेखों और एल्गोरिदम का विकास करने पर केंद्रित है। परिणाम: यह लेख फ़ंक्शन के साथ गणना करने की धारणा का अन्वेषण करता है, और बायोइन्फ़ॉर्मेटिक्स के लिए फ़ंक्शन के अंतलेखों के महत्व की व्याख्या करता है। EcoCyc डेटाबेस के लिए विकसित कार्यात्मक अंतलेख प्रस्तुत किया गया है। यह अंतलेख जैव रासायनिक प्रक्रियाओं की एक विविध श्रृंखला को कोड कर सकता है, जिसमें छोटे अणु समावेशी और मैक्रोमोलेक्यूलर समावेशी एंजाइमेटिक प्रतिक्रियाएँ, सिग्नल-आडंक्षण प्रक्रियाएँ, परिवहन घटनाएँ, और जीन अभिव्यक्ति के नियमन के तंत्र शामिल हैं। यह अंतलेख EcoCyc DB के लिए जटिल कार्यात्मक क्वेरी व्यक्त करने के लिए इसके उपयोग के माध्यम से मान्य किया गया है। संपर्क: pkarp@ai.sri.com