Affymetrix ओलिगोन्यूक्लियोटाइड माइक्रोएरे प्रयोगों में सामान्यीकरण के लिए एक बहुविभागीय विधि

Affymetrix उच्च-घनत्व ओलिगोन्यूक्लियोटाइड माइक्रोएरे यह संभव बनाते हैं कि किसी जीवित कोशिका में सैकड़ों हजारों जीन के अभिव्यक्ति प्रोफाइल को एक साथ मापा जा सके और इसलिए उनकी तुलना की जा सके। विभिन्न परिस्थितियों में भिन्न रूप से अभिव्यक्त जीन न केवल बुनियादी बल्कि चिकित्सा अनुसंधान के लिए भी बहुत महत्वपूर्ण हैं। हालाँकि, इन विभिन्न रूप से अभिव्यक्त जीनों के विशाल संख्या में उदाहरणों से पहचानने से पहले, गैर-जैविक कारकों द्वारा उत्पन्न महत्वपूर्ण परिवर्तन के कारण माइक्रोएरे डेटा को सामान्यीकृत करना आवश्यक है। पिछले कुछ वर्षों में, प्रॉब स्तर या प्रॉबसट स्तर की तीव्रताओं पर आधारित सामान्यीकरण विधियाँ साहित्य में प्रस्तावित की गई थीं। ये विधियाँ विभिन्न उद्देश्यों से प्रेरित थीं। इस पत्र में, हम एक बहुविभागीय सामान्यीकरण विधि प्रस्तावित करते हैं, जो आंशिक न्यूनतम वर्गों की प्रतिगमन पर आधारित है, जिसका उद्देश्य केंद्रीय प्रवृत्ति को समान करना, और साझा एरे में किसी भी प्रॉबसट के प्रॉब स्तर की तीव्रताओं का परिवर्तन कम करना और समान करना है। ऐसा करते हुए, हमें आशा है कि कोई जीन अभिव्यक्ति सूचकांकों का सटीक अनुमान लगा सकेगा।