कैंसर ट्रांसक्रिप्टोम का लक्षित अगले पीढ़ी अनुक्रमण अनुक्रम भिन्नताओं और नए फ्यूजन ट्रांसक्रिप्ट के पता लगाने को बढ़ाता है

लक्षित RNA-Seq अगली पीढ़ी अनुक्रमण को ट्रांसक्रिप्टोम के प्रासंगिक उपसमुच्चय से अनुक्रमों के कैप्चर के साथ जोड़ता है। जब एक ट्यूमर cDNA पुस्तकालय से अनुक्रमों को 467 कैंसर-संबंधित जीनों के लिए विशेष ओलिगोन्यूक्लियोटाइड प्रोब्स के हाइब्रिडाइज़ेशन द्वारा कैप्चर करने के द्वारा परीक्षण किया गया, तो इस विधि ने उच्च चयनात्मकता, बेहतर उत्परिवर्तन पहचान दिखाई जिससे नए काइमेरिक ट्रांसक्रिप्ट की खोज करने में सहायता मिली, और RNA अभिव्यक्ति डेटा प्रदान किया। इस प्रकार, लक्षित RNA-Seq "उच्च रुचि" जीनों के सेट की आणविक स्थिति का एक विस्तृत चित्र प्रस्तुत करता है।