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सारांश ट्रांसक्रिप्टोमिक तरीकों जैसे कि कैप एनालिसिस ऑफ जीन एक्सप्रेशन (CAGE) ट्रांसक्रिप्शन स्टार्ट साइट्स (TSS) की पहचान और प्रमोटर गतिविधि के मापन की अनुमति देते हैं। हालांकि, इन तकनीकों को बड़े RNA इनपुट की मात्रा की आवश्यकता होती है और ट्रांसक्रिप्ट बॉडीज का सिमल्टेनियस प्रोफाइल नहीं कर सकते। यहां, हम Smart-seq+5′, एक कम इनपुट लाइब्रेरी तैयारी दृष्टिकोण का उपयोग करते हुए फुल-लेंथ ट्रांसक्रिप्ट्स का वर्णन करने के लिए एक प्रोटोकॉल प्रस्तुत करते हैं जबकि TSSs के सटीक स्थान की पहचान भी करते हैं। हम RNA निकासी के चरणों का वर्णन करते हैं जिनमें वैकल्पिक इन विट्रो पॉलीएडेनिलेशन, रिवर्स ट्रांसक्रिप्शन और 5′ कैप्चर, ट्रांसक्रिप्ट कवरेज के लिए Tn5 टैगमेंटेशन, और कम्प्यूटेशनल विश्लेषण शामिल हैं। व्यापक रूप से अपनाए गए Smart-seq2 पर आधारित, Smart-seq+5′ संवेदनशीलता में सुधार प्रदान करता है और पॉलीएडेनिलेटेड और नॉन-पॉलीएडेनिलेटेड ट्रांसक्रिप्ट दोनों का प्रोफाइल बनाने के लिए उपयोग किया जा सकता है। इस प्रोटोकॉल के उपयोग और कार्यान्वयन पर पूरी जानकारी के लिए, कृपया Oomen et al.1 को संदर्भित करें।
Rodriguez‐Terrones et al. (मंगल,) ने इस प्रश्न का अध्ययन किया।