टी सेल रिसेप्टर सिग्नलिंग का मात्रात्मक फॉस्फोप्रोटियोमिक विश्लेषण प्रोटीन-प्रोटीन बातचीत के प्रणाली-व्यापी मॉड्यूलेशन का खुलासा करता है

टी सेल रिसेप्टर (टीसीआर) सिग्नलिंग के दौरान प्रोटीन फॉस्फोर्यलेशन घटनाएँ टीसीआर के निकट स्थित प्रोटीनों के बीच जटिलताओं के गठन, काइनस कैस्केड के सक्रियण और ट्रांसक्रिप्शन कारकों के सक्रियण को नियंत्रित करती हैं; हालाँकि, टी सेल सक्रियण से जुड़े विभिन्न घटनाक्रमों को समन्वयित करने में फॉस्फोर्यलेशन के प्रभाव का तरीका और स्तर स्पष्ट नहीं है। इसलिए, हमने मानव जुरकट टी सेल ल्यूकेमिया सेल लाइन को मॉडल प्रणाली के रूप में इस्तेमाल किया और टीसीआर सिग्नलिंग के बड़े पैमाने पर मात्रात्मक फॉस्फोप्रोटियोमिक विश्लेषण किए। हमने 10,665 अद्वितीय फॉस्फोर्यलेशन साइट्स की पहचान की, जिनमें से 696 ने टीसीआर-प्रतिक्रिया परिवर्तन दिखाए। इसके अतिरिक्त, हमने टी सेल सक्रियण से जुड़े अंतर्निहित तंत्रों का पता लगाने के लिए फॉस्फोर्यलेशन डेटा सेटों में व्यापक प्रवृत्तियों का विश्लेषण किया। हमने पाया कि, टीसीआर के उत्तेजना पर, फॉस्फोर्यलेशन घटनाएँ व्यापक रूप से सभी महत्वपूर्ण घटनाओं में शामिल प्रोटीन मॉड्यूल को लक्षित कर रही थीं: सतह प्रोटीन का पैटर्निंग, टीसीआर का एंडोसाइटोसिस, एफ-एक्टिन कप का गठन, इंटिग्रिन का अंदर-बाहर सक्रियण, माइक्रोट्यूब्यूल्स का ध्रुवीकरण, साइटोकाइन का उत्पादन और मैसेंजर आरएनए का वैकल्पिक स्पlicing। इसके अलावा, प्रासंगिक कार्यात्मक मॉड्यूल से संबंधित प्रोटीनों पर टीसीआर-प्रतिक्रियाशील फॉस्फोर्यलेशन साइट्स का मामले-दर-मामला विश्लेषण और नेटवर्क विश्लेषण ने हमें यह निष्कर्ष निकाला कि सरीन-थreonine (एस-टी) फॉस्फोर्यलेशन ने प्रणाली-व्यापी तरीके से प्रोटीन-प्रोटीन बातचीत (पीपीआईएस) को मॉड्यूलेट किया। हमने यह निष्कर्ष प्रयोगात्मक समर्थन भी प्रदान किया कि ट्यूबुलिन के छह अलग-अलग सरीन अवशेषों पर फॉस्फोर्यलेशन ने माइक्रोट्यूब्यूल्स के असेंबली के दौरान पीपीआईएस को समाप्त कर दिया। हम प्रस्तावित करते हैं कि एस-टी फॉस्फोर्यलेशन स्थिति में उत्तेजना-निर्भर परिवर्तनों द्वारा पीपीआईएस का मॉड्यूलेशन एक व्यापक घटना है जो कई अन्य सिग्नलिंग सिस्टम पर लागू होती है।