एकल सेल ट्रांसक्रिप्टोमिक्स और सतही प्रोटीन अभिव्यक्ति मानव RPESC-RPE और PSC-RPE में विशिष्ट कोशीय और आणविक गुणसूत्रों को उजागर करती है

उम्र से संबंधित मैक्यूलर डिजेनरेशन (AMD) के लिए परीक्षणों में वर्तमान रेटिनल पिगमेंट एपिथेलियम (RPE) सेल प्रतिस्थापन रणनीतियाँ या तो प्लुरिपोटेंट स्टेम सेल (PSC) या वयस्क RPE स्टेम सेल (RPESC) स्रोतों पर आधारित हैं। हमने सीकोन्सिंग द्वारा ट्रांसक्रिप्टोम और एपिटोप्स की सेलुलर इंडेक्सिंग (CITE-Seq) का उपयोग करके एकल-सेल ट्रांसक्रिप्टोमिक और सतही प्रोटीन जानकारी का एक साथ मूल्यांकन किया, इन दोनों RPE स्रोतों की तुलना करते हुए। RPESC-RPE और PSC-RPE दोनों ने प्रमुख RPE मार्करों को व्यक्त किया और सेलुलर विषमता का प्रदर्शन किया। हालांकि, RPESC-RPE में परिपक्व रेटिनल कार्यों से संबंधित जीनों की उच्च अभिव्यक्ति थी, जबकि PSC-RPE में स्टेम सेल विकास और विभेदन से संबंधित जीनों की अधिक अभिव्यक्ति थी। हमने दो सतही प्रोटीन पहचाने जो सेल प्रकारों में अंतर करते थे। "मुझे मत खाओ" संकेत, CD24, वयस्क RPESC-RPE कोशिकाओं पर प्रबलता से detect किया गया, जबकि CD57 अधिकांश PSC-RPE कोशिकाओं पर detect किया गया। जीन और सतही प्रोटीन अभिव्यक्ति में भिन्नताएँ यह सुझाव देती हैं कि दोनों RPE स्रोत कार्यात्मक, आसंजन, और इम्यूनोमोड्यूलेटरी गुणधर्मों में भिन्न हैं, जो प्रत्यारोपण के परिणामों पर प्रभाव डाल सकते हैं।