ट्रिप्सिन और काइमोट्रिप्सिन में सब्स्ट्रेट भेदभाव की संरचनात्मक उत्पत्ति

ट्रिप्सिन की विशेषता को काइमोट्रिप्सिन की विशेषता में बदलने के लिए प्रोटीन के कई हिस्सों में अमीनो एसिड का विनिमय आवश्यक होता है, जिसमें दो सतही लूप शामिल हैं जो सीधे सब्स्ट्रेट के संपर्क में नहीं आते। अब चाइमोट्रिप्सिन-समान विशिष्टता वाले दो उत्परिवर्तित ट्रिप्सिन का क्रिस्टलोग्राफिक विश्लेषण यह दर्शाता है कि ये दूरस्थ सतही लूप कार्य को बदलते हैं क्योंकि वे प्राथमिक बाइंडिंग साइट की संरचना को सीधे निर्धारित करते हैं। संबंधित सब्स्ट्रेट का कुशल एसीलेशन संरक्षित Gly216 अवशेष की एक विशिष्ट बैकबोन कॉन्फ़ॉर्मेशन के साथ सहसंबंधित है। यह अमीनो एसिड विशिष्टता पॉकेट की सतह पर स्थित है और एक गैर-विशिष्ट सब्स्ट्रेट के भाग के साथ दो मुख्य-श्रृंखला हाइड्रोजन बांड बनाता है। इसके विपरीत, दीर्घकीय Tyr172 अवशेष को Trp से बदलने से सब्स्ट्रेट बाइंडिंग क्षमता में सुधार अत्यधिक बुनियादी संरचना में संरचनात्मक पुनर्व्यवस्थाओं से उत्पन्न होता है। मिलकर, गतिशीलता और क्रिस्टलोग्राफिक डेटा यह सुझाव देते हैं कि Asp189 और Gly216 दोनों को ट्रिप्सिन में सब्स्ट्रेट विशिष्टता के प्राथमिक निर्धारकों के रूप में माना जाना चाहिए।