COVID-19 के लिए चिकित्सा का पुनः उपयोग: SARS-CoV-2 वायरल स्पाइक प्रोटीन और वायरल स्पाइक प्रोटीन-मानव ACE2 इंटरफेस के लिए सुपरकंप्यूटर-आधारित डॉकिंग

नवीन वुहान कोरोनावायरस (SARS-CoV-2) का अनुक्रमण किया गया है, और यह वायरस SARS-CoV के साथ महत्वपूर्ण समानता साझा करता है। यहाँ, मानव ACE2 रिसेप्टर के साथ बातचीत करने वाले SARS-CoV-2 के स्पाइक प्रोटीन (S-प्रोटीन) के कम्प्यूटेशनल मॉडल का उपयोग करके, हम दुनिया के सबसे शक्तिशाली सुपरकंप्यूटर, SUMMIT का उपयोग करते हैं, एक एंसेंबल डॉकिंग वर्चुअल हाई-थ्रूपुट स्क्रीनिंग अभियान चलाने और छोटे-मॉलिक्यूल्स की पहचान करने के लिए जो या तो मेज़बान रिसेप्टर क्षेत्र में अलग किए गए वायरल S-प्रोटीन से या S प्रोटीन-मानव ACE2 इंटरफेस से बंधते हैं। हम अनुमान लगाते हैं कि पहचाने गए छोटे-मॉलिक्यूल्स का पुनः उपयोग किया जा सकता है ताकि वायरल मेज़बान कोशिकाओं की पहचान को सीमित किया जा सके और/या मेज़बान-वायरस इंटरएक्शन को बाधित किया जा सके। ऐसे यौगिकों की एक रैंक की गई सूची दी गई है, जिनका प्रयोगशाला में परीक्षण किया जा सकता है।