HLA-DR अल्फा चेन अवशेषों की पहचान जो विषाक्त शॉक सिंड्रोम विष के सुपरेंटिजेन के साथ बंधने के लिए महत्वपूर्ण हैं।

स्टैफिलोकोकल विषाक्त शॉक सिंड्रोम विष 1 (TSST-1) प्रमुख संगति जटिलता वर्ग II अणुओं से बंधता है, और विष-श्रेणी II जटिल टी कोशिकाओं के गुणन को प्रेरित करते हैं जो V बीटा 2 अनुक्रम व्यक्त करते हैं। TSST-1 बंधने में शामिल अवशेषों को परिभाषित करने के लिए, 21 HLA-DR अल्फा चेन म्यूटेंट्स को व्यक्त करने वाले ट्रांसफेक्टेंट्स के एक सेट का विश्लेषण किया गया। DR अल्फा की स्थिति 36 और 39 में उत्परिवर्तन ने DR7 अणु की TSST-1 के साथ बंधने और प्रस्तुत करने की क्षमता को स्पष्ट रूप से कम कर दिया लेकिन एंटीजन पेप्टाइड प्रस्तुत करने की क्षमता पर कोई असर नहीं पड़ा। ये डेटा यह संकेत करते हैं कि DR अल्फा अवशेष 36 और 39, जो एक बाहरी लूप पर स्थित होने की भविष्यवाणी की गई है, DR अणुओं पर TSST-1 बंधन स्थल के निर्माण में महत्वपूर्ण हैं।