Key points are not available for this paper at this time.
जीन कार्यात्मक विवरण उम्मीदवार जीनों के लिए एक महत्वपूर्ण साक्ष्य रेखा प्रदान करते हैं जो लक्षण विविधता के पीछे होते हैं। इसके विपरीत, पौधों का पर्यावरणीय संकेतों के प्रति प्रतिक्रिया जीन कार्य को समझने और इसके बाद जीन संपादन के माध्यम से पौधों के सुधार के लिए अणु लक्ष्यों को प्रदान करने के लिए महत्वपूर्ण संसाधन प्रस्तुत करती है। हालाँकि, पौधों की फाइलोजनी में कई जीनों की जैविक भूमिकाएँ अच्छी तरह से वर्णित नहीं हैं। यहाँ हम संयुक्त जीनोम संस्थान (JGI) पौधा जीन एटलस का वर्णन करते हैं, जो 18 विभिन्न प्रजातियों में ट्रांसक्रिप्ट समृद्धि परीक्षणों का एक अद्यतन योग्य डेटा संसाधन है। इन विभिन्न जीनोटाइप्स में समेकन के लिए, हमने अभिव्यक्ति प्रोफाइलों का विश्लेषण किया, ऐसे जीन क्लस्टर बनाए जो ऊतक/स्थिति विशिष्ट अभिव्यक्ति प्रदर्शित करते थे, और पर्यावरणीय संकेतों के प्रति ट्रांसक्रिप्शनल प्रतिक्रिया का परीक्षण किया। हमने उन जीनों के लिए व्यापक फाइलोजेनिक रूप से प्रतिबंधित और स्थिति-विशिष्ट अभिव्यक्ति प्रोफाइल खोजे जिनका पहले से कोई कार्यात्मक नामांकन नहीं था। इस प्रकार के संरक्षित अभिव्यक्ति पैटर्न और तंग सह-अभिव्यक्त जीन क्लस्टर्स ने हमें 64,495 जीनों को अभिव्यक्ति के माध्यम से अतिरिक्त जैविक जानकारी को असाइन करने की अनुमति दी जिनके कार्य अज्ञात थे। लगातार विकसित हो रहा जीन एटलस संसाधन JGI पौधा जीन एटलस (https://plantgeneatlas.jgi.doe.gov) और फाइटोज़ोम (https://phytozome.jgi.doe.gov/) पर उपलब्ध है, जो डेटा और उपयोगकर्ता-निर्दिष्ट जीन सेट के लिए थोक पहुंच प्रदान करता है। ये वेब इंटरफेस उपयोगकर्ताओं को भिन्नतापूर्ण अभिव्यक्त जीनों तक पहुँचने, जीन एटलस पौधों के बीच आर्थोलॉग को ट्रैक करने, सह-अभिव्यक्त जीनों का ग्राफिकल प्रतिनिधित्व करने और जीन ऑंटोलॉजी और मार्ग समृद्धियों का दृश्य बनाने की अनुमति देते हैं।
Sreedasyam et al. (मंगलवार,) ने इस प्रश्न का अध्ययन किया।