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फाइलम Ascomycota बिना किसी संदेह के फफूंद साम्राज्य में सबसे बड़ा समूह है। पारिस्थितिकी के लिहाज से महत्वपूर्ण पारस्परिक संघ जैसे कि माइकोराइज़ा और लाइकेन इस समूह में विकसित हुए हैं, जिन्हें भूमि पौधों के विकास का समर्थन करने वाली प्रमुख नवाचार के रूप में माना जाता है। आणविक घड़ी के तरीकों का उपयोग करके Ascomycota उपभेदों के उद्भव की तारीख के लिए केवल कुछ प्रयास किए गए हैं, जो संतोषजनक जीवाश्म कैलिब्रेशन डेटा की कमी के कारण है। इस कारण से, हमने एम्बर (अल्बियन से माइओसीन) और चर्ट (डेवोनियन और मास्ट्रिच्टियन) से उपलब्ध सबसे पुराने Ascomycete जीवाश्मों का मूल्यांकन किया है। ये जीवाश्म पांच प्रमुख Ascomycete वर्गों (कोनीसाइबोमायसेट्स, डोथिडियोमायसेट्स, यूरोटियोमायसेट्स, लैबौल्बेनियोमायसेट्स और लेकेनोरोमायसेट्स) का प्रतिनिधित्व करते हैं। हमने Ascomycota के अधिकांश समूहों का प्रतिनिधित्व करने वाले कुल 145 वर्गों से एक बहु-जीन डेटा सेट (18SrDNA, 28SrDNA, RPB1 और RPB2) को इकट्ठा किया है और Ascomycetes के अंदर से केवल जीवाश्म कैलिब्रेशन बिंदुओं का उपयोग करते हुए Ascomycota उपभेदों के विभाजन समय का अनुमान लगाने के लिए एक बायेसियन दृष्टिकोण का उपयोग किया है। हमारे परिणाम इंगित करते हैं कि Pezizomycotina का आरंभिक विविधीकरण ऑर्डोविसियन में हुआ, उसके बाद फेनारोज़ोइक के दौरान उपभेदों का बार-बार विभाजन होता रहा, और यह इंगित करता है कि यह निरंतर विविधीकरण बड़े विनाशों से प्रभावित नहीं हुआ। हम सुझाव देते हैं कि प्रत्येक उपभेद के भीतर पारिस्थितिकी विविधता ने सुनिश्चित किया कि प्रत्येक समूह के कुछ वर्ग वैश्विक संकटों को सहन करने में सक्षम थे और तेजी से पुनर्प्राप्त हुए।
Beimforde et al. (Wed,) ने इस प्रश्न का अध्ययन किया।