Ly-5 जीन का संगठन।

एक एकल Ly-5 जीन विभिन्न प्रकार के ट्रांसमेम्ब्रेन ग्लाइकोप्रोटीन आइसोफॉर्म उत्पन्न करने के लिए जाना जाता है, जो चूहे के हेमटोपोइएटिक विकासात्मक कम्पार्टमेंट के भीतर विभिन्न कोशिका वंशों और विभेदन (डिफरेंटिएशन) के चरणों में अंतर करते हैं। Ly-5 के समरूप सिस्टम चूहों (rats) और मनुष्यों में ज्ञात हैं। इस रिपोर्ट में Ly-5 जीन के संपूर्ण एक्सॉन-इंट्रॉन संगठन का वर्णन किया गया है। Ly-5 जीन क्रोमोसोम 1 के लगभग 120 किलोबेस पर स्थित है और इसमें 34 एक्सॉन शामिल हैं, जिनमें से 32 (Ex-3 से Ex-34) प्रोटीन कोडिंग हैं। Ex-1, Ex-2, और Ex-3 व Ex-34 के कुछ भाग अनट्रांसलेटेड (अनुवादित नहीं) हैं। जांचे गए सभी cDNA क्लोन में, या तो Ex-1 या Ex-2 का प्रतिनिधित्व था, लेकिन दोनों का नहीं, जिससे यह संकेत मिलता है कि Ly-5 mRNA में Ex-1 और Ex-2 परस्पर अनन्य (mutually exclusive) हो सकते हैं। ट्रांसक्रिप्शन के लिए इनिशिएशन (कैप) साइटों की पहचान करने के लिए प्राइमर एक्सटेंशन और S1 न्यूक्लीज़ प्रोटेक्शन मैपिंग का उपयोग किया गया था। Ex-1 और Ex-2 के लिए संभावित कैप साइटों और संबंधित TATA-जैसे अनुक्रमों की खोज दो प्रमोटरों की उपस्थिति का सुझाव देती है। Ex-1+ और Ex-2+ दोनों cDNA क्लोनों में अगला एक्सॉन Ex-3 है, जिसमें एक ट्रांसलेशन-इनिशिएटिंग कोडन होता है। Ex-3 और Ex-4 के बीच का इंट्रॉन असामान्य रूप से लंबा, लगभग 50 किलोबेस का है। यह प्रमाण दिया गया है कि Ex-5, Ex-6 और Ex-7 (पहले अध्ययन किए गए) की तरह, एक अन्य वैकल्पिक एक्सॉन है जो वैकल्पिक स्प्लिसिंग द्वारा वास्तविक या संभावित Ly-5 आइसोफॉर्म उत्पन्न करने के लिए अकेले या Ex-6 या Ex-7 या दोनों के साथ चुनिंदा रूप से प्रोग्राम किया जाता है।