ジャミング遷移としてのタンパク質のフォールディング

タンパク質は、安定性を制御する密に詰まった疎水性コアを持つ特定の機能的立体構造に折りたたまれます。我々は、実験的測定で見られる普遍的なコア詰め率ϕc=0.55を説明する、幾何学的でありながら全原子モデルのタンパク質を開発します。疎水性相互作用が温度に対して相対的に増加するとき、コア詰め率がϕcを超えると新たなジャミング遷移が発生することを示します。このモデルは、部分的に unfolded な状態から自然に近い構造に正確に再フォールディングすることができるため、タンパク質の全体構造を再現します。