OneOPESによる絶対結合自由エネルギー

タンパク質-リガンド系の絶対結合自由エネルギー（ABFE）の計算は、長い間課題となっていました。最近、洗練された力場とアルゴリズムにより、ABFE計算の質が向上しました。しかし、創薬努力を支えるために必要とされる精度を達成することは依然として困難です。ここでは、シンプルな幾何学的集合変数を使用して、OneOPESによる絶対結合自由エネルギーの正確な計算のための移植可能な強化サンプリング戦略を提示します。この戦略を、分子フラグメントおよび薬物様分子を含む合計17種類の化学的に多様なリガンドと複合化された2つのタンパク質標的、BRD4およびHsp90でテストしました。結果は、OneOPESがタンパク質-リガンド結合親和性を1 kcal mol以内の平均無符号誤差で正確に予測することを示しています。