Prorocentrum triestinum ACIZLEM2からのRNA抽出のためのTrizol法の改良

有害藻類繁茂（HABs）のサンプルでは、海水には微生物や元素イオンが高密度で含まれることがあります。Prorocentrum triestinumのような主要なHAB有孔虫の壁が硬いため、RNA抽出は非常に困難です。これらの成分はRNAの分離を妨げ、その劣化を引き起こすほか、HABの複雑な海水特性がRNA分離を妨害し、有効なRNAシーケンシングやトランスクリプトームプロファイリングを困難にします。本研究では、−20 °Cで凍結されたP. triestinumの細胞ペレットにMicropestle Systemを適用することにより、Trizol法の改良によりRNA分離技術を確立しました。これは400 mLの培養から107細胞/mLを取得したものです。改良されたTrizolプロトコルの結果、Analyzer Agilent 4150での測定によってトランスクリプトミクスシーケンシング用の質の高いRNAサンプルが生成されました。