シダ植物のための効率的かつ効果的なRNA抽出プロトコル

要約 前提 高品質なRNAの抽出は、遺伝子発現と遺伝子空間の分析における重要な最初のステップです。これは特に植物、特にシダ植物において困難であり、細胞壁の破壊と核酸からの有機化合物の分離は簡単ではありません。方法 我々は、広範な系統のシダ植物において一貫して良好に機能する、セチルトリメチルアンモニウムブロミド（CTAB）ベースのRNA抽出プロトコルを開発しました。この植物系統は二次化合物が豊富です。また、様々な組織タイプにおいても使用可能です。2つの代替オプション（沈殿法と中間沈殿なしのクリーンアップ）を提示しており、いずれもOD 260/280 = 1.9–2.1およびOD 260/230 > 1.6の光学密度比とRNA整合性番号 >7を達成する高品質なRNA抽出物を得られます。結論 本研究は、複数の組織とシダ植物の系統を横断する高品質RNAの抽出に関する効率的なプロトコルを提示します。この植物系統は、ゲノム資源の開発において他の主要系統に比べて依然として遅れています。この方法がそのギャップを埋める手助けとなることを期待しています。