ゲノム全体の比較解析がチリカバッファローの塩分適応に基づく選択の署名を浮き彫りにする

チリカはインド東海岸の原産のバッファロー品種で、ベンガル湾に接続されたチリカの汽水湖周辺に主に分布しています。この品種は、湖の塩水に深く潜り、そこに留まって塩性の地元の植物を食べるという独特の能力を持っています。塩分に対する適応は遺伝的現象ですが、塩分耐性の遺伝的基盤は家畜、特に動物においてはまだ限られています。本研究は、チリカバッファローが過酷な塩性環境に適応するための遺伝的進化を探るもので、水分と食物システムの両方を含んでいます。この研究では、18頭のチリカバッファローと比較のために10頭の通常の生息環境のムラバッファローの全ゲノム再配列データを生成しました。選択スイープの特定には、群内および群間統計が使用されました。ヌクレオチド多様性(θπ)、田島のD、ヌクレオチド多様性比(θπ-比)、およびFを使用して、チリカバッファローの709、309、468、および354の遺伝子が選択スイープを持つことが検出されました。