TCMNP: 伝統中国医学ネットワーク薬理学のためのデータ処理および視覚化データベースおよびRパッケージ

要約 背景 ネットワーク薬理学は、伝統中国医学（TCM）の作用メカニズム研究において重要です。しかし、現在、伝統中国医学ネットワーク薬理学（TCMNP）におけるデータ処理および視覚化にはいくつかの課題があります。私たちは、R環境ベースのソフトウェアデータベースとパッケージTCMNPを開発しました。 方法 TCMNPは、TCM化合物、漢方薬、成分、対応するターゲットおよび経路の組成の分析と視覚化のために設計されています。「dplyr」、「clusterProfiler」、「ggplot2」、および「circlize」パッケージを使用したRでのデータ分析および視覚化、ならびに私たち自身が作成した関数を使用します。 結果 TCMNPは、TCM化合物、漢方薬、成分、対応するターゲットおよび経路の組成の分析と視覚化のために設計されています。TCMNPデータベースには571種類のTCM漢方薬、17,118成分、10,013疾病、および15,956ターゲットが含まれています。TCMNPはデータ分析プロセスを簡略化し、中国漢方化合物の組成、成分およびターゲットの自動スクリーニング、豊富化分析視覚化、タンパク質相互作用およびTFとターゲット遺伝子のスクリーニングの一連のプロセス操作を実現します。さまざまな種類の組み込み関数は、TCMネットワーク薬理学の視覚化のための整然としたインターフェースを提供します。 TCMNPデータベースは無料で利用可能です：https://tcmlab.top/tcmr。TCMNPパッケージは無料で利用可能です：https://github.com/tcmlab/TCMNP。 結論 TCMNPデータベースとパッケージは、TCM化合物の成分間の相互関係と、疾患治療に対するその潜在的な影響の包括的な概要を提供します。TCMNPデータベースは無料で利用可能です：https://tcmlab.top/tcmr/。TCMNPパッケージは無料で利用可能です：https://github.com/tcmlab/TCMNP。私たちは、TCMNPが疾患治療のためのTCMのメカニズムを探求するのに役立つことを期待しています。