緑地は都市の哺乳類における腸内微生物叢の構造的レジリエンスに寄与する

野生動物の腸内マイクロバイオームは、人間による環境の変化に関連するさまざまな環境要因の影響を受けます。私たちは、ストライブドフィールドマウス（Apodemus agrarius）という同都市性の齧歯類の腸内細菌叢が、さまざまな規模の都市でどのように変化するかを調査し、この種の都市微生物叢の特徴を探りました。分析のための糞便サンプルは、非都市化地域および異なる規模の都市の緑地に住む動物から収集されました（ポーランド）。メタゲノム16S rRNA遺伝子シーケンシングとさらなるバイオインフォマティクス解析が行われました。調査対象の集団間で腸内マイクロバイオームの組成に有意差が見られましたが、観察された変化は地元の生息地条件に依存し、都市化されたエリアのサイズとの相関関係の強い証拠はありませんでした。結果は、より自然で非都市的な環境からの生態的な切り離しが、調査された齧歯類において「都市微生物叢」モデルの発展を自動的に引き起こすわけではないことを示唆しています。緑地での自然環境への曝露は、マイクロバイオームの変化の触媒として機能し、都市の哺乳類における在来の腸内微生物群の維持に対して以前は過小評価されていた寄与を提供する可能性があります。