妊娠を維持するための牛胚の能力をスコアリングするための公式の開発

牛や他の種における胚移植は、遺伝的な価値を向上させるための重要な生殖技術です。しかし、胚移植後の妊娠喪失は、この技術の最適な活用に対する主要な障壁となっています。さらに、胚の能力を客観的に定量化する方法がないため、胚の能力を改善するための研究が妨げられています。牛胚には妊娠成立能力を決定する内因性の分子シグネチャーが存在し、これが異なる遺伝子発現プロファイルをもたらすことが知られています。私たちは、独立した実験からのトランスクリプトームデータを統合し、生存能力の予測に高い精度を持つ8つの遺伝子を特定しました。本研究では、これら8つの重要な遺伝子の発現に基づいて、モデル係数を用いた数学的公式を含むRソフトウェア用の関数を開発し、胚能力インデックス（ECI）を生成しました。この関数を遺伝子発現データセットに適用することで、各胚のための定量的なECI値を生成し、実験を行う際の統計解析に利用できます。Rプロジェクトおよび必要なデータセットのフォルダーは、https://zenodo.org/records/12515587 にあります。