病院の廃水処理前後におけるESKAPEE細菌の存在と持続

廃水における抗菌剤耐性のメタゲノミクス監視は、抗生物質耐性菌の分布、状態、および傾向を特徴付けるための方法論的ツールとして提案されています。本研究では、2020年2月から3月にかけて病院に関連する生の廃水および処理済み廃水の横断的サンプル収集が行われました。ショットガンメタゲノムシーケンシングおよびバイオインフォマティクス分析が実施され、細菌の豊富さと抗菌耐性遺伝子の分析が行われました。すべてのサンプルに見られた主な細菌門は以下のとおりです：プロテオバクテリア、バクテロイデス、ファーミキューテス、およびアクチノバクテリア。種レベルでは、E. coliなどのESKAPEE細菌の相対的豊富さは生の廃水と処理済み廃水の間で減少しましたが、S. aureus、A. baumannii、およびP. aeruginosaは増加し、K. pneumoniaeの持続性も生の廃水と処理済み廃水の両方で増加しました。合計172種類の抗菌薬耐性遺伝子 (ARG) が検出されました； blaOXA、blaVEB、blaKPC、blaGES、mphE、mef、erm、msrE、AAC(6′)、ant(3″)、aadS、lnu、PBP-2、dfrA、vanA-G、tet、およびsulが最も高い豊富さと持続性で見つかりました。この研究は、病院の廃水の三次処理プロセスを生き延びるESKAPEE細菌の能力と、環境中で広がっている臨床的に重要な抗菌耐性遺伝子の持続性を示しています。