Phylobook: 分類群の注釈と分子系統からの配列の抽出のためのツール

可変病原体からの配列データの量が増加するにつれて、特定の分類群を分析、注釈、および抽出する手段が難しくなります。この挑戦に対処するために、Phylobookが開発されました。配列アライメントファイルから始まり、Phylobookは系統樹を生成し、突然変異の位置を示すハイライタープロットの隣に表示し、ユーザーが系統と組換えを特定し、選択した配列のサブセットを注釈付けし、下流の分析のためにエクスポートできるようにします。自動化が難しい正確な系統割り当ては、異なるクラスター化手法によって作成された注釈を使用することで支援されます。Phylobookは、専門家による系統割り当ての評価と修正、ならびに下流の分析のための抽出を可能にするために、ウェブベースの表示を自動クラスタリングと手動編集と組み合わせて提供します。