体外CRISPRスクリーニングによる細胞外DNAは、細胞外DNA放出の主要な仲介者としてアポトーシスを特定する

臨床的循環細胞外DNA（cfDNA）検査は現在一般的ですが、検査の精度は限られています。cfDNAのライフサイクルを理解することで、検査性能を向上させる機会を特定できるかもしれません。ここでは、24の細胞株パネルを通じてcfDNA放出をプロファイリングし、細胞外CRISPRスクリーニング（cfCRISPR）を利用してcfDNA放出の仲介者を特定しました。私たちのパネルは、臨床サンプルに類似してcfDNAを放出しアポトーシスの特徴とされる細胞株と、粒子状または壊死DNAに関連する大きな断片を放出する別の細胞株の2つの異なるグループを示します。cfCRISPRスクリーニングの結果、cfDNA放出を仲介する遺伝子の主な関与はアポトーシスであることがわかりましたが、cfDNA放出の潜在的な調節因子としてRNA結合タンパク質などの他の遺伝子のサブセットも特定されました。特定された両方の細胞株グループは、主にアポトーシスを介してcfDNAを生成することが確認されました。これらの結果は、cfCRISPRの有用性を確立し、in vitroでのDNA放出の主要な仲介者としてアポトーシスを遺伝的に検証し、cfDNAアッセイを改善する方法を示唆しています。