要約 LB185: 長読みナノポアシーケンシングを使用したヒトの癌および老化における高解像度テロメア測定

要約 テロメアの長さは細胞の複製能力や老化の重要なバイオマーカーであるが、既存の測定方法は解像度と精度に制限がある。ヒトの癌形成の過程では、テロメアは腫瘍侵入に先立つ初期段階で深刻に短縮する。テロメアの短縮は、細胞の老化や死を誘発することで癌の進行を止めるか、染色体を不安定にし染色体再配置を生成することで癌の発展を促進することができる。テロメアの安定化は、通常テロメラーゼのアップレギュレーションによって行われ、ほぼすべてのヒト癌の進行に必要である。本研究では、ナノポアシーケンシングによるデジタルテロメア測定を用いて、ヒトのテロメア長の分布が老化中および癌形成後にどのように変化するかを理解する。遺伝的に定義されたヒト幹細胞の集団、健康な個人の末梢血細胞、テロメア維持に遺伝的欠陥のある患者、癌患者、癌細胞株からのテロメアの減少と新規伸長を前例のない解像度で測定する。ヒトの老化は、白血球における長いテロメアの漸進的な喪失と短いテロメアの蓄積を伴うことが分かった。テロメア維持における遺伝性欠陥を持つ患者では、短いテロメアの蓄積がより顕著で、表現型の重症度と相関している。機械学習を適用して、健康な個人とテロメア生物学障害のある個人を区別するための二項分類モデルをトレーニングした。次に、患者と一致する健康な結腸上皮を持つ20の大腸腫瘍のコホートのテロメア長を調査した結果、大腸腫瘍の3分の2が周囲の正常組織に比べてテロメア長の分布が有意に短いことが分かった。最後に、癌細胞株におけるテロメア長の分布の臨床応用可能な疾患バイオマーカーとしての有用性を探求する。このシーケンシングおよびバイオインフォマティクスパイプラインは、テロメア維持機構の理解を進め、老化および疾患の臨床バイオマーカーとしてのテロメア長の使用を促進するだろう。引用形式: Santiago Sanchez, Jessica Gu, Anudeep Golla, William Shomali, Annika Martin, Dirk Hockemeyer, Sharon Savage, Steven Artandi. 長読みナノポアシーケンシングを使用したヒトの癌および老化における高解像度テロメア測定の要約。米国癌研究協会年次総会2024の議事録; パート2 (遅延発表、臨床試験、および招待講演); 2024年4月5-10日; サンディエゴ, CA。フィラデルフィア(PA): AACR; Cancer Res 2024;84 (7Suppl): 要約番号 LB185.