HNSCCにおける予後リスクを予測するスプライシング因子の特徴の同定と新規腫瘍遺伝子の機構的役割

頭頸部扁平上皮癌（HNSCC）は頭頸部癌の最も頻繁なサブタイプであり、一般的に予後が良くなく、非常に異質な悪性腫瘍のため治療選択肢が限られています。本研究では、HNSCC患者の予後と密接に関連した機能的なスプライシング調節RNA結合タンパク質（RBP）をスクリーニングし、HNSCC腫瘍と正常組織の間で有意な発現差を示しました。この発見に基づき、予後予測モデルを生成するために6つの候補遺伝子（HNRNPC、ZCRB1、RBM12B、SF3A2、SF3B3、SRSF11）を選択し、患者の生存結果を予測するための予測モデルの精度を検証しました。我々のモデルによって予測されたリスクスコアは、独立した予後予測因子として機能することを確認しました。特に、SF3B3、HNRNPC、またはZCRB1の発現が高いHNSCC腫瘍は、発見された予測モデルで高いリスクスコアを持っていました。基礎的なメカニズムの調査では、SF3B3、HNRNPC、およびZCRB1のそれぞれのノックダウンがHNSCC細胞の生存を大幅に損なうことが確認されました。逆に、これら三つの遺伝子の過剰発現は腫瘍細胞の増殖を促進しました。高スループットRNAシーケンシング解析により、SF3B3およびHNRNPCの発現の変化が細胞周期調節に関連する遺伝子の代替スプライシングに顕著な影響を及ぼすことが明らかになりました。一方、ZCRB1の減少はDNA損傷応答に関与する異常なスプライシング事象に寄与しました。さらに、予後予測モデルのリスクスコアは免疫浸潤スコアと関連していることが示されました。特に、SF3B3はCD8A発現との負の相関を持っています。したがって、我々の発見は、HNSCCの治療効果を向上させるための有望な予後予測因子と潜在的な治療標的を提供します。