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このプロトコルの目的は、環境RNA(eRNA)分析のために0.45 µmのSterivex™フィルターユニットを用いて水サンプルのサンプリングと濾過を行うことです。このプロトコルは、魚のeRNAを特定するために分子生物学的分析(例:qPCR、メタバーコーディング、ddPCR)の前段階で使用されます。eRNAは容易に分解されるため、特別な注意が必要です。これには、除染された機器を使用することでRNase汚染を制限し、サンプリング後は非常に迅速に濾過を行い、濾過後は液体窒素または-80°Cの冷凍庫でサンプルを非常に迅速に冷凍することが含まれます。常温でRNAを安定化させるための保存緩衝液は利用可能ですが、このプロトコルでは使用されません。このプロトコルでは、サンプルの特性および選択された濾過方法(シリンジまたは真空ポンプ)に応じて、Sterivexフィルターユニットを通じて約0.5 Lから5 Lを濾過することができます。
マリン・ヴォティエ(Fri、)はこの問題を研究しました。