抄録 大腸がん検診の導入により前癌性腺腫の発見と切除が増加したが、多くは患者の生涯で大腸癌 (CRC) に進展しない。これは、腺腫から癌への移行における重要な進化的ボトルネックを示し、浸潤細胞の増殖抑制に免疫監視が中心的役割を果たしている可能性が高い。本研究では、「ca-in-ads」(小さな癌巣を含む腺腫)コホートを解析し、浸潤移行の独自のスナップショットを提供した。ゲノミクス、空間トランスクリプトミクス、デジタル病理学、多重イメージングを組み合わせ、腫瘍クローンの分布、それらの遺伝子発現、および免疫微小環境との相互作用を同時に導出した。40例の保存されたca-in-adsから多領域低被覆全ゲノムシークエンス(lcWGS)とT細胞受容体シークエンス(当研究室で開発した新手法FUME-TCRseqを使用)を実施した。一部の症例では、10x Genomics Visiumプラットフォームを用いた空間トランスクリプトミクスを実施し、関心のあるT細胞クローンタイプを検出するためのカスタムプローブも含めた。ヘマトキシリン・エオジン染色(H&E)に深層学習細胞分類器を適用した。2025年12月4-6日;アルバカーキ、ニューメキシコ。フィラデルフィア(PA):AACR;Cancer Res 2025;85 (23Suppl): 抄録番号 PR004。
Sakrら(木曜)がこの問題を研究した。