A Multi-Omics Approach to Unravel the Epigenetic and Topological Mechanisms Underlying Colorectal Tumorigenesis

La transcripció, a més d'estar modulada per factors de transcripció, activadors i repressors, entre d'altres, està regulada per una interacció dinàmica i complexa de capes epigenètiques, que inclouen l'accessibilitat a la cromatina, les modificacions de les histones i l'organització tridimensional del genoma. Tanmateix, la mesura en què aquestes capes contribueixen al càncer colorectal (CCR) encara no s'ha caracteritzat prou. L'objectiu d'aquesta Tesi Doctoral és integrar la topologia espacial del genoma amb l'expressió gènica i capes òmiques addicionals (ATAC-seq i CUT&RUN per a H3K27ac i H3K27me3) en organoides de còlon de ratolí sans i en organoides que porten les mutacions més freqüents en pacients amb CCR (Apc, Trp53, Smad4 i Kras). Aquest enfocament busca proporcionar nous coneixements biològics sobre com els mecanismes epigenètics impulsen la regulació transcripcional en el context del CCR.