免疫療法で治療された頭頸部癌における予後バイオマーカーのシングルセル解析

背景: 腫瘍タイプに依存しない22個の保護的遺伝子（P）および19個の悪性遺伝子（A）からなる複合遺伝子発現シグネチャー（cGES）を開発し、免疫療法（IO）治療患者を3つのリスク群（低リスク（L-）、中間リスク（I-）、高リスク（H-））に層別化しました（要旨#6360 AACR2025）。ここでは、前向きコホートでの無増悪生存期間（PFS）および全生存期間（OS）の予測価値を検証し、臨床結果の基礎にあるシングルセルおよび空間的決定因子を明らかにします。方法: (1) cGESを2つの試験（NCT03226756; NCT03412058）からの局所進行/転移性頭頸部扁平上皮癌（LA/M SCCHN）患者170名で算出。 (2) 次に、Hリスク患者19名、Lリスク患者21名を含む77名の独立患者からの219,138細胞のscRNAseq SCCHNアトラス（scAt）を構築し、2群間での細胞集団の分布と機能状態を解析。細胞タイプ特異的なA遺伝子の優先的発現は上皮および間質細胞で、P遺伝子は主に免疫細胞で発現。Hリスク腫瘍は上皮接合の強化、発生シグナル、EGFRのリガンド-受容体活性の普遍的増加による変化した細胞間通信を示し、Lリスク腫瘍は細胞外リモデリング、適応免疫活性化、免疫細胞動員による免疫豊富なネットワークを特徴。 (3) Visiumデコンボリューションにより5つの主要な細胞組成クラスターを同定し、上皮細胞豊富なC2はA遺伝子発現が最も高く、T細胞豊富なC4/C5はP遺伝子発現が最も強かった。Hリスク腫瘍は顕著なEGFRリガンド発現を示し、scAtデータと一致。対照的にLリスク腫瘍は抗原提示、T細胞走化、補体系シグナル増加を示した。結論: cGESは予後を的確に層別化し、腫瘍エコシステムの生物学を反映している。Hリスク腫瘍は上皮駆動のEGFR中心シグナル支配、Lリスク腫瘍は協調的な炎症性T細胞指向プログラムを示した。これらの所見はcGESを予後および機序的バイオマーカーとして示唆し、LA/M SCCHNの治療成績向上のためのEGFR-IO併用戦略の根拠を提供する。引用形式: Mehdi Lamkhioued, Thimothee Casini, Elodie Girard, Karène Mahtouk, Sonia Canjura-Rodriguez, Valery Attignon, Bastien Cabarrou, Constance Lamy, Anne Schnitzler, Frederique Penault-Llorca, Caroline Even, Christophe Le Tourneau, Ellen Van Obberghen-Schilling, Nicolas Servant, Fayette Jerome, Nathalie Bendriss-Vermare, Ivan Bièche, Pierre Saintigny. Single cell and spatially resolved determinants of the clinical outcome of patients (pts) treated with locally advanced/metastatic head and neck squamous cell carcinoma (LA/M SCCHN) treated with immunotherapy (IO) abstract. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2026; Part 1 (Regular Abstracts); 2026 Apr 17-22; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2026;86(7 Suppl):Abstract nr 1037.