頭頸部扁平上皮癌のエクソームシーケンシングによってNOTCH1における不活化変異が明らかになった

頭頸部扁平上皮癌（HNSCC）は、世界で6番目に一般的な癌である。この癌の遺伝的起源を探るために、私たちは全エクソームシーケンシングおよび遺伝子コピー数分析を用いて32の原発腫瘍を研究した。タバコ使用歴のある患者からの腫瘍は、タバコを使用しない患者からの腫瘍よりも多くの変異を持ち、ヒトパピローマウイルス（HPV）陰性の腫瘍はHPV陽性の腫瘍よりも多くの変異を持っていた。複数の腫瘍で変異が見られた6つの遺伝子は、最大88の追加のHNSCCで評価された。TP53、CDKN2A、PIK3CA、およびHRASに以前に記述された変異に加えて、FBXW7およびNOTCH1の変異を特定した。NOTCH1で特定された28の変異のほぼ40％が遺伝子産物を切断することが予測されており、NOTCH1はこの腫瘍タイプにおいて腫瘍抑制遺伝子として機能する可能性があることを示唆している。