SCoPE-MS: 単一哺乳類細胞の質量分析は細胞分化中のプロテオームの異質性を定量化します

いくつかの興味深い生物学的質問は、単一細胞内の何千ものタンパク質を定量化することを必要とします。この目標を達成するために、我々は質量分析による単一細胞プロテオミクス（SCoPE-MS）を開発し、タンパク質群に基づいて異なるヒト癌細胞タイプを特定する能力を検証します。SCoPE-MSを用いて、分化中のマウス胚性幹細胞において1000以上のタンパク質を定量化します。単一細胞のプロテオームは、細胞集団を解体し、タンパク質の豊富さの関係を推測することを可能にします。単一細胞のプロテオームとトランスクリプトームの比較は、mRNAとタンパク質の協調した変動を示しますが、多くの遺伝子はmRNAとタンパク質レベルで機能的に協調された異なる調節パターンを示します。