BUSCA: タンパク質の細胞内局在を予測するための統合ウェブサーバー

ここでは、タンパク質の細胞内局在を予測するための異なる計算ツールを統合した新しいウェブサーバーBUSCA (http://busca.biocomp.unibo.it) を紹介します。BUSCAは、シグナルペプチドやトランジットペプチド（DeepSigおよびTPpred3）、GPIアンカー（PredGPI）、および膜貫通ドメイン（ENSEMBLE3.0およびBetAware）の識別方法を、球状および膜タンパク質の細胞内局在を識別するためのツール（BaCelLo、MemLoci、SChloro）と組み合わせて利用します。異なるツールからの結果は処理され、真核生物および細菌のタンパク質配列の細胞内局在を注釈付けするために統合されます。BUSCAは、最近のCAFA実験および他の特定のデータセットから派生したタンパク質ターゲットに対してベンチマークを行い、最新の性能を報告します。BUSCAは、CAFA2からの2732のターゲットに対して評価されたすべての方法より優れており、F1値は0.49で、CAFA3からのターゲット予測においても最良の方法の一つです。私たちは、タンパク質の細胞内局在の注釈付けのための統合され、正確なリソースとしてBUSCAを提案します。