PlantCARE：植物のシス作用調節エレメントのデータベースおよびプロモーター配列のインシリコ解析用ツールポータル

PlantCAREは植物のシス作用調節エレメント、エンハンサーおよびリプレッサーのデータベースです。調節エレメントは位置マトリックス、コンセンサス配列、特定プロモーター配列上の個別サイトで表現されています。利用可能な場合はEMBL、TRANSFAC、MEDLINEデータベースへのリンクが提供されます。転写サイトに関するデータは主に文献から抽出され、増加しているインシリコ予測データで補完されています。特定の転写因子サイトの一般的説明に加え、実験的証拠の信頼レベル、機能情報、プロモーター上の位置も示されています。クエリ配列中の植物シス作用調節エレメント検索機能が新たに実装されました。さらに、共発現遺伝子クラスターの解析のための新しいクラスタリングおよびモチーフ検索方法へのリンクも提供されています。新規調節エレメントは自動送信でき、キュレーション後にデータベースへ追加されます。PlantCAREリレーショナルデータベースはhttp://sphinx.rug.ac.be:8080/PlantCARE/にてワールドワイドウェブ経由で利用可能です。