抗生物質治療後の微生物叢の部分的回復

抗生物質は腸内微生物叢に深刻な影響を与え、微生物群を調整します。最近、抗菌薬が抗生物質耐性遺伝子の存在量と分布にも影響を及ぼすことを観察しました。この付録では、抗生物質治療前後の配列レベルでの包括的なゲノムの違いを定量化するために、約1兆ヌクレオチドのショットガンメタゲノムデータセットを再解析しました。私たちは、セフプロジルへの7日間の曝露がメタゲノム配列の統計的に有意な喪失につながることを示しました。抗生物質療法後3ヶ月の腸内微生物叢の回復は、抗生物質曝露前には見られなかった新しいゲノム配列の出現によって特徴づけられました。初期の腸内微生物多様性が低い参加者は、抗生物質耐性に関連する配列の量が増加しました。したがって、微生物叢の分類学的組成は抗生物質の影響を部分的に受ける一方で、細菌群のゲノム内容と集団構造は顕著に影響を受けることを示唆します。