イルミナシーケンシングライブラリにおけるPCR増幅バイアスの分析と最小化

イルミナシーケンシングデータの出力が増加し続けるにもかかわらず、極端な塩基組成を持つローカスはしばしば過小評価されるか、不在となる。塩基組成バイアスの要因を評価するために、定量的PCRによって6%から90%のGC含量を持つゲノム配列を追跡した。ライブラリ調製中のPCRが主要なバイアスの原因であることを特定し、その条件を最適化した。改善されたプロトコルは増幅バイアスを大幅に低減し、以前は深刻な影響を及ぼしていたPCR機器及び温度上昇速度の影響を最小限に抑えた。