チュートリアル：水素/重水素交換質量分析法の化学

タンパク質の分析のための水素/重水素交換質量分析法（HDX-MS）に関連する化学が説明される。まず、文献に記載された観察された速度をレビューすることによって、タンパク質中のさまざまな機能基のHDX速度が説明され、次にプロトン移動理論およびpKa値を用いてタンパク質中の全ての種類のヘテロ原子水素の速度が推定される。推定されたHDX速度は、インドールおよびアミド基を除くほとんどの機能基に対する観察された速度と良好に一致する。これらの基に対する観察された速度と推定されたHDX速度の不一致は反応メカニズムによって説明される。第二に、サイドチェーン、N末端およびC末端、pH、温度、有機溶剤、および同位体を含むバックボーンアミド水素のHDX速度に影響を与える要因について議論される。これらの要因は、交換反応および下流プロセスの適切な設計に加え、HDX-MSデータの分析および解釈にとって重要である。