肝臓ミトコンドリア機能のシステムプロテオミクス

定量的プロテオミクス手法、特にすべての理論的質量スペクトルの逐次ウィンドウ取得（SWATH-MS）の最近の改善により、多様なコホートにわたる再現可能な大規模タンパク質測定が可能になりました。ゲノミクス、トランスクリプトミクス、その他の技術と組み合わせることで、広範な分子相互作用ネットワークにわたる詳細な分析を可能にするトランスオミクスデータセットを生成できます。ここでは、BXDマウス参照集団の386人のゲノム、トランスクリプトーム、プロテオーム、メタボロームを通じて肝代謝に対するミトコンドリアの関連性を調べます。遺伝的バリアントとトランスクリプト、タンパク質、メタボライト、表現型の間にいくつかの関連が確認されました。これらの中で、Cox7a2lの配列バリアントは、そのタンパク質の活性を変え、それがミトコンドリア超複合体形成の下流の違いにつながります。このデータセットは、プロテオームを包括的に定量化できるようになり、トランスクリプトミクス、ゲノミクス、メタボロミクスへの重要な補完となることを示しています。これは複雑な形質解析を進めるための組み合わせです。