ハーバード医科大学のトランスジェニックRNAiプロジェクト：リソースと検証

ショウジョウバエにおける大規模機能研究を促進するために、ハーバード医科大学(HMS)のショウジョウバエトランスジェニックRNAiプロジェクト(TRiP)が設立され、いくつかの目標が設定されました：すべての組織で機能する効率的なRNAiベクターの開発、コミュニティからの入力を得たゲノム規模のRNAiストックのコレクションの生成、既存のストックセンターを通じて生成されたラインの配布、RT-qPCRおよび表現型分析を用いた可能な限り多くのラインの検証、およびRNAiラインの特定とその品質に関する既存情報の取得のためのツールとウェブリソースの開発です。これらの目標を念頭に置き、私たちが開発したさまざまなツールとコレクションの状況について詳しく説明します。現在、このコレクションは11,491ラインで構成され、ショウジョウバエ遺伝子の71％をカバーしています。ラインのRT-qPCRまたは表現型による特性評価に関するデータは、専用のウェブサイトで入手可能で、RNAiストック検証と表現型プロジェクト(RSVP, http://www.flyrnai.org/RSVP.html)として知られています。ストックは、アメリカのブルーミントンショウジョウバエストックセンター、日本の国立遺伝学研究所、中国の清華大学のフライセンターから入手できます。