新しい統計基準が構成の非一様性によって引き起こされる系統樹バイアスを検出

DNA配列の統計的系統解析において、進化的変化のモデルは通常、塩基組成が時間と系統にわたって定常であると仮定します。この仮定は多くのデータセットで破られていますが、これらの違反の大きさが系統推論を誤らせるのに十分かどうかは不明です。私たちは、モデルの適合性を評価する方法を用いて、構成の非一様性が系統推定に及ぼす影響を調査しました。詳細なシミュレーション研究に基づいて、一般的な頻度主義の基準は非常に保守的であり、系統推定に明確なバイアスの兆候が見られない場合、モデルがしばしば拒否されることが分かりました。新しい基準を提案し、その使用に関するガイドラインを提供します。これらの基準を40種類の鳥類からのゲノム規模のデータに適用したところ、非常に非均質な塩基組成を持つ遺伝子座は珍しく見つかりました。私たちの結果は、系統ゲノミクス分析においてモデルの適合性をテストする際に、十分に情報を持った診断統計を使用する重要性を示しています。