南アイダホ水産業における感染性造血壊死ウイルスの分子疫学は、ウイルスの複雑な流通と進化を明らかにする

感染性造血壊死ウイルス（IHNV）は、サケ科魚類に感染し、最大90％の致死率を引き起こす可能性のあるラブドウイルスです。アイダホ州ハゲルマンバレーでは、IHNVは多数の魚類養殖場や資源対策孵化場の間でエンデミックまたはエピデミックです。以前の研究では、4つのウイルスエンデミックレインボートラウト養殖場における84のIHNV分離株の遺伝的多様性を特徴づけた結果、相対的に高い多様性を持つ複数の系統がこれらの施設で共存していることが示されました（Troyer et al. 2000 J Gen Virol. 81:2823-2832）。この地域全体の養殖施設内で高いIHNV遺伝的多様性と共存する系統が存在するという仮説を検証しました。この研究では、1978年から1999年までに分離されたハゲルマンバレーの14のレインボートラウト養殖場および3つの州の孵化場からの73のウイルス分離株を、グリコプロテイン遺伝子の303ヌクレオチド領域の配列解析によって遺伝的に特徴づけました。系統樹解析および疫学的分析により、複数のIHNV系統が谷の私立トラウト養殖場および州の孵化場で複雑なパターンで共存していることが示されました。谷内に維持されるIHNVは、22年間の研究期間中に著しく進化しているようです。