RNAウイルスにおける有害変異負荷の系統発生学的証拠とウイルス進化への寄与

RNAウイルスの集団はしばしば豊富な遺伝的変異を特徴としています。しかしながら、これらの変異の相対的適応度はほとんど知られておらず、この情報はウイルスの出現、免疫回避、薬剤耐性の理解において中心的な役割を果たします。ここでは、143種類のRNAウイルスの構造遺伝子における多型の相対的適応度を評価するために、非同義変化と同義変化の分布に基づいた系統発生的手法を開発しました。これにより、RNAウイルスの自然集団で観察されるアミノ酸変異のかなりの割合は、一時的な有害変異で構成されており、その後浄化選択によって排除され、ウイルスの適応性を制限している可能性があることが明らかになりました。また、アミノ酸の変動性と多型の系統発生的分布の関係の存在を初めて示しました。この関係から、RNAウイルスにおける最大の生存可能な有害変異負荷の経験的閾値を提案します。