病原体発見の危険性：新しいパルボウイルス様ハイブリッドゲノムの起源が核酸抽出スピンカラムに追跡される

次世代シーケンシングを使用して、パルボウイルス科とサーコウイルス科の間に位置する新しい、非常に分岐したDNAウイルスの発見とde novoアセンブリを行いました。このウイルスは、一時的にパルボウイルス様ハイブリッドウイルス（PHV）と名付けられ、以前に中国の非A-E型肝炎の患者において検出された別のDNAウイルス、NIH-CQVと配列がほぼ同一です。最初は広範な臨床サンプルでPHVを検出しましたが、全ての株がNIH-CQVと約99％のヌクレオチドおよびアミノ酸同一性を共有しましたが、ウイルスの正確な起源は、核酸抽出に使用された汚染されたシリカ結合スピンカラムに遡ることが最終的に判明しました。PHVおよびおそらくNIH-CQVの起源が確定的に確認されるのは、汚染されたスピンカラムを通じて溶出された水の詳細な分析によって得られました。環境メタゲノムライブラリの分析により、北アメリカの沿岸海域でPHVの配列が検出され、スピンカラムに使用されるシリカマトリックスを生成するケイソウ類（藻類）との間にPHVとの潜在的な関連があることが示唆され、製造中に意図しないウイルス汚染が生じた可能性があります。PHV/NIH-CQVが実験室試薬の汚染物質であり、人間の真正な感染因子ではないことが確認されたことで、次世代シーケンシングによって発見された新しいウイルスゲノムの妥当性を確立するために必要な厳密なアプローチが強調されています。