ラジカルペアナビゲーションにおける量子もつれと情報理論

このリポジトリには、原稿「ラジカルペアナビゲーションにおける量子もつれと情報理論」で使用された計算フレームワーク、シミュレーションコード、原データが含まれています。PythonおよびPythonの量子ツールボックス（QuTiP v4.7）を使用してシミュレーションフレームワークを構築しました。このコードは、鳥類の磁気受容に関与するFAD•−/Trp•+ラジカルペアメカニズム（RPM）の開いた量子系の動力学をモデル化しています。リポジトリには、以下を計算するスクリプトが含まれています：スピンハミルトニアンダイナミクス：FAD•−およびTrp•+ラジカルのゼーマン相互作用と主な超微細結合を組み込んだ二電子スピンハミルトニアンの構築。オープンシステムの進化：生物的デコヒーレンスチャネル（スピン緩和、環境的位相消去、ラジカル再結合）下での単一状態と三重状態の個体数の時間的進化を追跡するためのリンドブラッド主方程式の統合。量子フィッシャー情報（QFI）：ラジカルペアコンパスの基本的な角度感度の限界を決定するための対称対数微分およびQFIの計算。情報理論：地球の磁場の向きと分子信号状態間のシャノン相互情報およびチャネル容量の計算。