持続的な細菌感染への進化的ハイウェイ

持続的感染は、細菌が宿主内での適応を同時に最適化することによって、無知なコロナイゼーション状態から進化することを必要とします。これは進化的傾向を覆い隠し、感染管理を複雑にする可能性があります。したがって、ここでは、39人の若年性嚢胞性線維症患者からの443の縦断的なPseudomonas aeruginosa分離株のうち、8つの感染関連表現型をスクリーニングします。統計モデルを使用して、進化的軌跡をマッピングし、患者特有の影響を考慮した表現型の相関関係を特定します。474の分離株に関する以前の遺伝的分析を統合することで、宿主への初期適応への窓口を提供し、次のことを発見します：(1) コロナイゼーション後の急速な適応の2-3年のタイムライン、(2) 表現型と遺伝的適応間の不一致を反映する変異「無知」および「適応」状態、(3) 三つの異なる進化モードを通じて持続的感染に至る適応軌道、(4) 表現型と病原適応変異の間の新しい関連。最終的に、私たちは複雑な表現型適応を効果的に解明し、臨床微生物学における進化的研究および精密医学のための枠組みを提供します。